无尘室门窗上的缝隙分为固定缝隙和活动缝隙。性质不同在无尘室门、窗上所占比例也不同。无尘室门、窗密闭采取的气密措施也不完全相同。自控装置保证全程调节。目前，有的生产厂家采用手动方式进行控制风量和风压的调节，但由于控制风量和风压的调节阀均在技术隔层，而且吊顶也都是彩钢板的软吊顶，基本上都是在安装调试时调好，此后，大都没再调节过，实际上也无法调节。连续速度调节控制：此系统连续速度调节控制与多档开关控制方式相比，多了一个连续速度调节器，使FFU风机转速连续可调，但同时也牺牲了电机效率，使其能耗比多档开关控制方式还要高。
FFU的维护管理：采用FFU送风方式时，往往不是单台设备而是数十台、数百台FFU布置在吊顶上，因此给维护管理带来一定的难度。一般过滤器从洁净室内进行更换，而风机多数需要在龙骨架顶端(静压箱内部)维护，但如果静压箱没有足够的高度无法从内部维护风机时，那么就要考虑从无尘室内部进行维护风机的可行性了。总之，在应用FFU时要根据实际情况进行考虑,达到既保留其特点又降低成本的目的。
无尘室噪音控制：FFU的风机一般为几台甚至几十台并联使用，当设计时要考虑FFU噪音的叠加，保证《洁净室厂房设计规范GB0073-2001》中明确规定“洁净室内的噪音级(空态),非单向流洁净室不应大于60dB，单向流、混合流洁净室不应大于65dB”的要求。因此在选择风机时zui好选择、压出式、直驱后径向叶片风机，这样可以降低整体噪音。